Comparison of four routinely used methods for assessing root colonization by arbuscular mycorrhizal fungi.

Quantifying the proportion of roots colonized by arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) is routine work for researchers conducting AMF studies. However, in practice, the methods are always misused, with their adaptability to different conditions neglected. In this study, four frequently used methods (root segment ±, root segment estimation, grid-line intersect, and magnified intersections) were evaluated and compared. Using the light microscopy based staining technique, we assessed AMF colonization of the roots of five plant species ( Trifolium repens Linn., Zea mays Linn., Robinia pseudoacacia Linn., Populus simonii Carr., and Caragana korshinskii Kom.). The results revealed that a root length of at least 150 cm (rather than the usual 30 or 50 cm or 100 to 150 intersections generally used when following these four methods) should be examined to represent a single root sample whatever the method used. All four methods had good reproducibility, even though there was a high level of divergence among the results obtained using the different methods to assess the same root sample. We concluded that when assessing the AMF colonization of roots from the same species, all methods except the root segment ± method can be used; however, when assessing root samples from different species, the root segment estimation and magnified intersections methods give more reliable results. We suggest that the root segment ± method is an effective method for revealing the uniformity of AMF distributed in host roots of a certain length. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

La quantification de la proportion des racines colonisées par les champignons mycorhiziens arbusculaires (CMA) constitue un travail de routine pour les chercheurs étudiant les CMA. Cependant, en pratique, les méthodes sont souvent mal utilisées et sans adaptation à différentes conditions. Les auteurs comparent et évaluent quatre méthodes fréquemment utilisées (méthode du segment racinaire ±, méthode d'estimation par segment racinaire, méthode d'intersection des lignes sur grille et méthode d'intersections agrandies). À l'aide de la microscopie photonique et de colorations, les auteurs ont évalué les colonisations des racines chez cinq espèces de plantes ( Trifolium repens Linn., Zea mays Linn., Robinia pseudoacacia Linn., Populus simonii Carr. et Caragana korshinskii Kom.). Les résultats montrent qu'une longueur de racine minimum de 150 cm (plutôt que 30 ou 50 cm ou les intersections de 100 ou 150 généralement utilisées lors de l'utilisation de ces méthodes) devrait être examinée pour représenter un échantillon individuel, quelle que soit la méthode utilisée. Toutes les quatre méthodes donnent des résultats reproductibles, bien qu'on observe un fort degré de divergence parmi les résultats obtenus en utilisant les différentes méthodes pour évaluer le même échantillon racinaire. Les auteurs concluent que lorsque l'on évalue la colonisation CMA de racines provenant d'une même espèce toutes les méthodes, sauf la méthode du segment racinaire ±, peuvent être utilisées; cependant, lorsque l'on évalue des échantillons racinaires de différentes espèces la méthode d'estimation du segment racinaire et la méthode d'intersections agrandies donnent des résultats plus fiables. Ils suggèrent que la méthode du segment racinaire ± constitue une méthode efficace pour révéler l'uniformité de la distribution des CMA dans les racines de l'hôte, d'une certaine longueur. [ABSTRACT FROM AUTHOR]