Abstract: Il a été démontré que le réassortiment des segments génétiques entre et au sein des lignées grippales B (Victoria et Yamagata) génère de nouveaux réassortiments avec des caractéristiques génétiques uniques. Sur la base des gènes de l'hémagglutinine (HA) et de la neuraminidase (NA), une étude de surveillance récente a identifié des propriétés de réassortiment dans le virus de type B/Phuket/3073/2013, qui est actuellement utilisé dans le vaccin antigrippal recommandé par l'OMS. Pour comprendre les modèles de réassortiment potentiels pour tous les segments de gènes, quatre virus de type B/Phuket/3073/2013 et deux réassortiments uniques (un de Yamagata et un de Victoria) détectés en Malaisie de 2012 à 2014 ont été soumis à un séquençage du génome entier. Chaque gène a été classé phylogénétiquement en lignées, clades et sous-clades. Trois virus de type B/Phuket/3073/2013 de la lignée Yamagata se sont avérés être des réassorti intra-clade, possédant des gènes PA et NA dérivés du sous-clade Stockholm/12, tandis que les gènes restants du sous-clade Wisconsin/01 (les deux sous-clades se trouvaient dans le clade Yamagata 3/Yam-3). Cependant, l'autre virus semblable à B/Phuket/3073/2013 avait un gène NS dérivé du sous-clade semblable à Stockholm/12 au lieu du sous-clade semblable à Wisconsin/01. Un réassortiment inter-clades avait une HA et une NP dérivées de Yamagata Clade 2/Yam-2, et ses gènes restants étaient dérivés de Yam-3. Dans le clade Victoria 1/Vic-1 de la lignée Victoria, un virus avait des propriétés de réassortiment intra-clade : HA et PB2 du sous-clade Vic-1B, MP et NS d'un sous-clade unique « Vic-1C », et les gènes restants du sous-clade Vic-1A. Bien que l'événement de réassortiment aléatoire puisse générer des réassortiments uniques, la classification phylogénétique détaillée des segments de gènes a montré une liaison génétique possible entre les gènes PA et NA dans les virus de type B/Phuket/3073/2013, ce qui nécessite des recherches plus approfondies. La compréhension des modèles de réassortiment dans l'évolution de la grippe B peut contribuer à la conception future du vaccin.
Se ha demostrado que la reordenación de segmentos genéticos entre y dentro de los linajes de influenza B (Victoria y Yamagata) genera nuevos reordenamientos con características genéticas únicas. Basado en los genes de la hemaglutinina (HA) y la neuraminidasa (NA), un estudio de vigilancia reciente ha identificado propiedades de redistribución en el virus similar a B/Phuket/3073/2013, que se utiliza actualmente en la vacuna contra la gripe recomendada por la OMS. Para comprender los posibles patrones de redistribución para todos los segmentos génicos, se sometieron a secuenciación de todo el genoma cuatro virus similares a B/Phuket/3073/2013 y dos recombinantes únicos (uno de Yamagata y otro de Victoria) detectados en Malasia entre 2012 y 2014. Cada gen se clasificó filogenéticamente en linajes, clados y subclados. Se encontró que tres virus similares a B/Phuket/3073/2013 del linaje Yamagata eran reagrupados dentro del clado, que poseían genes PA y NA derivados del subclado similar a Estocolmo/12, mientras que los genes restantes del subclado similar a Wisconsin/01 (ambos subclados estaban dentro del clado 3 de Yamagata/Yam-3). Sin embargo, el otro virus similar a B/Phuket/3073/2013 tenía un gen NS que derivaba del subclado similar a Estocolmo/12 en lugar del subclado similar a Wisconsin/01. Un reordenante entre clados tenía HA y NP derivados del clado 2 de Yamagata/Yam-2, y sus genes restantes eran derivados de Yam-3. Dentro del clado Victoria 1/Vic-1 en el linaje Victoria, un virus tenía propiedades de reordenamiento intraclado: HA y PB2 del subclado Vic-1B, MP y NS de un subclado único "Vic-1C", y los genes restantes del subclado Vic-1A. Aunque el evento de reordenamiento aleatorio puede generar reordenamientos únicos, la clasificación filogenética detallada de los segmentos génicos mostró un posible vínculo genético entre los genes PA y NA en virus similares a B/Phuket/3073/2013, lo que requiere una mayor investigación. La comprensión de los patrones de redistribución en la evolución de la influenza B puede contribuir al diseño futuro de la vacuna.
Reassortment of genetic segments between and within influenza B lineages (Victoria and Yamagata) has been shown to generate novel reassortants with unique genetic characteristics. Based on hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) genes, recent surveillance study has identified reassortment properties in B/Phuket/3073/2013-like virus, which is currently used in the WHO-recommended influenza vaccine. To understand the potential reassortment patterns for all gene segments, four B/Phuket/3073/2013-like viruses and two unique reassortants (one each from Yamagata and Victoria) detected in Malaysia from 2012-2014 were subjected to whole-genome sequencing. Each gene was phylogenetically classified into lineages, clades and sub-clades. Three B/Phuket/3073/2013-like viruses from Yamagata lineage were found to be intra-clade reassortants, possessing PA and NA genes derived from Stockholm/12-like sub-clade, while the remaining genes from Wisconsin/01-like sub-clade (both sub-clades were within Yamagata Clade 3/Yam-3). However, the other B/Phuket/3073/2013-like virus had NS gene that derived from Stockholm/12-like sub-clade instead of Wisconsin/01-like sub-clade. One inter-clade reassortant had Yamagata Clade 2/Yam-2-derived HA and NP, and its remaining genes were Yam-3-derived. Within Victoria Clade 1/Vic-1 in Victoria lineage, one virus had intra-clade reassortment properties: HA and PB2 from Vic-1B sub-clade, MP and NS from a unique sub-clade "Vic-1C", and the remaining genes from Vic-1A sub-clade. Although random reassortment event may generate unique reassortants, detailed phylogenetic classification of gene segments showed possible genetic linkage between PA and NA genes in B/Phuket/3073/2013-like viruses, which requires further investigation. Understanding on reassortment patterns in influenza B evolution may contribute to future vaccine design.
وقد تبين أن إعادة تصنيف الشرائح الوراثية بين سلالات الأنفلونزا B وداخلها (فيكتوريا وياماغاتا) تولد متجانسات جديدة ذات خصائص وراثية فريدة. استنادًا إلى جينات هيماجلوتينين (HA) ونورامينيداز (NA)، حددت دراسة ترصد حديثة خصائص إعادة التصنيف في فيروس شبيه بالفيروس B/Phuket/3073/2013، والذي يستخدم حاليًا في لقاح الأنفلونزا الموصى به من قبل منظمة الصحة العالمية. لفهم أنماط إعادة التشكيل المحتملة لجميع شرائح الجينات، تم إخضاع أربعة فيروسات شبيهة بالفيروس B/Phuket/3073/2013 واثنين من المتشابهين الفريدين (واحد من كل من ياماغاتا وفيكتوريا) تم اكتشافهم في ماليزيا من 2012-2014 لتسلسل الجينوم الكامل. تم تصنيف كل جين وراثيًا إلى سلالات وفرعيات وفرعيات. تم العثور على ثلاثة فيروسات شبيهة بالفيروس B/Phuket/3073/2013 من سلالة ياماغاتا لتكون مصلحات داخل الكسوة، وتمتلك جينات PA و NA مشتقة من ستوكهولم/12 - like sub - clade، في حين أن الجينات المتبقية من ويسكونسن/01 - like sub - clade (كانت كلتا الفئتين الفرعيتين داخل Yamagata Clade 3/Yam -3). ومع ذلك، فإن الفيروس الآخر الشبيه بالفيروس B/Phuket/3073/2013 يحتوي على جين NS مشتق من ستوكهولم/12 - like sub - clade بدلاً من ويسكونسن/01 - like sub - clade. كان أحد المتجانسين بين الأصناف يحتوي على Yamagata Clade 2/مشتق من Yam -2 HA و NP، وكانت جيناته المتبقية مشتقة من Yam -3. داخل فيكتوريا كلايد 1/فيكتوريا 1 في سلالة فيكتوريا، كان لفيروس واحد خصائص إعادة تشكيل داخل الكسوة: HA و PB2 من الكسوة الفرعية Vic -1B، MP و NS من الكسوة الفرعية الفريدة "Vic -1C"، والجينات المتبقية من الكسوة الفرعية Vic -1A. على الرغم من أن حدث إعادة التشكيل العشوائي قد يولد إعادة تشكيل فريدة من نوعها، إلا أن التصنيف الوراثي التفصيلي لشرائح الجينات أظهر ارتباطًا وراثيًا محتملاً بين جينات PA و NA في الفيروسات الشبيهة بالفيروس B/Phuket/3073/2013، مما يتطلب مزيدًا من البحث. قد يساهم فهم أنماط إعادة التشكيل في تطور الأنفلونزا ب في تصميم اللقاح في المستقبل.
Processing Request
No Comments.