Contributors: Morphologie et Images (MORPHEME); Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM); Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut de Biologie Valrose (IBV); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA)-Signal, Images et Systèmes (Laboratoire I3S - SIS); Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Reproduction et développement des plantes (RDP); École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon); Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Sainsbury Laboratory Cambridge University (SLCU); University of Cambridge UK (CAM); Modeling plant morphogenesis at different scales, from genes to phenotype (VIRTUAL PLANTS); Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP); Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro); ANR-14-CE11-0013,Dig-Em,Embryons digitaux: une analyse géométrique quantitative de la morphogenèse et de son évolution chez les ascidies(2014)
Abstract: International audience ; The shoot apical meristem (SAM) is at the origin of all the plant above-ground organs (including stems, leaves and flowers) and is a biological object of interest for the understanding of plant morphogenesis. The quantification of tissue growth at a cellular level requires the analysis of 3D microscopic image sequences of developing meristems. To address inter-individual variability, it is also required to compare individuals. This obviously implies the ability to process inter-individual registration, i.e. to compute spatial and temporal correspondences between sequences from different meristems.In the present work, we propose a spatial registration method dedicated to microscopy floral meristem (FM) images, and the identification, for a given still image of a meristem, of its best corresponding time-point in a sequence of an other individual (temporal registration).
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