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Constrained signal classification, application to the study of the neuronal protein tau ; Classification contrainte de signaux, application à l'étude de la protéine neuronale tau

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  • Additional Information
    • Contributors:
      Statistique pour le Vivant et l’Homme (SVH); Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK); Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Modélisation aléatoire de Paris X (MODAL'X); Université Paris Nanterre (UPN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); ESME - École spéciale de mécanique et d'électricité (ESME); Dynamique et Structure du Cytosquelette Neuronal; GIN Grenoble Institut des Neurosciences (GIN); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA); All the computations presented in this paper were performed using the GRICAD infrastructure (\url{https://gricad.univ-grenoble-alpes.fr}), which is supported by Grenoble research communities.; Société Française de Statistique; Université libre de Bruxelles; ANR-11-LABX-0025,PERSYVAL-lab,Systemes et Algorithmes Pervasifs au confluent des mondes physique et numérique(2011); ANR-19-P3IA-0003,MIAI,MIAI @ Grenoble Alpes(2019)
    • Publication Information:
      CCSD
    • Publication Date:
      2023
    • Collection:
      Université Paris Lumières: HAL
    • Subject Terms:
    • Abstract:
      International audience ; This work is motivated by an application in neuroscience, in particular by the study of the (dys)functioning of a protein called Tau. The objective is to establish a classification of intensity profiles, according to the presence or absence of the protein and its monomer or dimer proportion. For this, we propose here a Gaussian mixture model with a fixed number of groups whose mean parameters are constrained and shared by the groups. The inference of this model is done via the classical EM algorithm. The performance of the method will be evaluated via simulation studies and an application on real data will be done. ; Ce travail est motivé par une application en neuroscience, en particulier par l'étude du (dys)fonctionnement d'une protéine appelée Tau. L'objectif est d'établir une classification de profils d'intensité, selon la présence ou pas de la protéine et sa proportion monomère ou dimère. Pour cela, nous proposons ici un modèle de mélange gaussienne en un nombre fixé de groupes dont les paramètres de moyennes sont contraints et partagés par les groupes. L'inférence de ce modèle est faite via l'algorithme classique EM. La méthode proposée sera évaluée via des études de simulations et une application sur des données réelles sera effectuée. Mots-clés. Données fonctionnelles, Classification automatique, Modèle de mélange, paramètres contraints, algorithme ECM.
    • Online Access:
      https://hal.science/hal-04182472
      https://hal.science/hal-04182472v2/document
      https://hal.science/hal-04182472v2/file/462825.pdf
    • Rights:
      info:eu-repo/semantics/OpenAccess
    • Accession Number:
      edsbas.5A862103