Abstract: A critical analysis of the article by S. V. Mylnikov (Scientific Editor and Publisher. 2023;8(1 Suppl):S52–S61) in the form of a correspondence dialogue is conducted. Aspects such as frequentist and Bayesian point and interval estimation of the parameters of binomial and polynomial distributions, linear correlation coefficient (r), coefficient of determination (R2), linear regression parameters, difference (PD) and proportion ratio (RR), odds ratio (OR), estimation of minimum required sample sizes, advantages of statistical estimation based on bootstrap, random number generator, graphical methods of statistical analysis: décolleté and whisker boxes, probability plots, histograms, Gardner-Altman plots, rain clouds, corrections for multiple comparisons, complexities of correlation analysis, effect size, replication probabilities (prep, psrep and prerep), mid-p values, prediction intervals for p values, for effect sizes, and for combined effects in meta-analysis. A description of the programs recommended for solving the discussed statistical problems is presented. ; Проведен критический разбор статьи С. В. Мыльникова (Научный редактор и издатель. 2023;8(1 Suppl):S52–S61) в форме заочного диалога. Обсуждены такие аспекты, как частотнические и бейзовские точечные и интервальные оценки параметров биномиального и полиномиального распределений; коэффициента линейной корреляции (r); коэффициента детерминации (R2); параметров линейной регрессии; разности (PD) и отношения долей (RR); отношения шансов (OR); оценки минимально необходимых объемов выборок; преимущества статистического оценивания на основе бутстрепа; генератор случайных чисел; графические методы статистического анализа: коробы с декольте и с усами, вероятностные графики, гистограммы, графики Гарднера-Олтмена, дождевые облака; поправки на множественность сравнений; сложности корреляционного анализа; размер эффекта; вероятности воспроизведения (prep, psrep и prerep); значения mid-p; предсказательные интервалы для pзначений, для размеров эффекта и для суммарных ...
Relation: https://www.scieditor.ru/jour/article/view/398/253; Cumming G., Calin-Jageman R. Introduction to the New Statistics Estimation, Open Science, and Beyond. 2nd ed. Routledge; 2024. 610 p. https://doi.org/10.4324/9781032689470; Hopkins W. A new view of statistics. 2014. Available at: https://complementarytraining.net/wp-content/uploads/2013/10/Will-Hopkins-A-New-View-of-Statistics.pdf (accessed: 27.01.2024).; Мыльников С. В. Доверительные интервалы и точное значение p в научной статье в медико-биологическом журнале. Научный редактор и издатель. 2023;8(1 Suppl):S52–S61. https://doi.org/10.24069/SEP-23-13; Halverson M. S., Bolnick D. A. An ancient DNA test of a founder effect in Native American ABO blood group frequencies. American Journal of Physical Anthropology. 2008;137(3):342–347. https://doi.org/10.1002/ajpa.20887; Clopper C. J., Pearson E. S. The use of confidence or fiducial limits illustrated in the case of the binomial. Biometrika. 1934;26(4):404–413. https://doi.org/10.1093/biomet/26.4.404; Глотов Н. В., Животовский Л. А., Хованов Н. В., Хромов-Борисов Н. Н. Биометрия. Л.: Изд-во ЛГУ; 1982. 263 с.; Khurshid A., Ageel M. I. Binomial and Poisson confidence intervals and its variants: A bibliography. Pakistan Journal of Statistics and Operation Research. 2010;6(1):75–100. https://doi.org/10.18187/pjsor.v6i1.139; Мыльников С. В. Азы биометрии. СПб.: Издательство Н-Л; 2007. 56 с.; Haynes A. G., Lenz A., Stalder O., Limacher A. presize: An R-package for precision-based sample size calculation in clinical research. Journal of Open Source Software. 2021;6(60):3118. https://doi.org/10.21105/joss.03118; Hammer Ø., Harper D. A. T., Ryan P. D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia Electronica. 2001;4(1):4. Available at: http://palaeo-electronica.org/2001_1/past/issue1_01.htm (accessed: 27.01.2024).; Закс Л. Статистическое оценивание [Ю. П. Адлер, В. Г. Горкий (ред.); В. Н. Варыгин (пер.)]. М.: Статистика; 1976. 598 с.; Sachs L. Applied Statistics. A Handbook of Techniques. 2nd ed. New York: Springer; 1984. 707 p.; Spitzer M., Wildenhain J., Rappsilber J., Tyers M. BoxPlotR: a web tool for generation of box plots. Nature Methods. 2014;11(2):121–122. https://doi.org/10.1038/nmeth.2811; Ho J., Tumkaya T., Aryal S., Choi H., Claridge-Chang A. Moving beyond P values: Data analysis with estimation graphics. Nature Methods. 2019;16(7):565–566. https://doi.org/10.1038/s41592-019-0470-3; Allen M., Poggiali D., Whitaker K., Marshall T. R., van Langen J., Kievit R. A. Raincloud plots: a multiplatform tool for robust data visualization [version 2; peer review: 2 approved] Wellcome Open Research. 2021;4:63. https://doi.org/10.12688/wellcomeopenres.15191.2; JASP Team 2023. JASP (version 0.18.1). [Computes software]; Louis T. A., Zeger S. L. Effective communication of standard errors and confidence intervals. Biostatistics. 2009;10(1):1–2. https://doi.org/10.1093/biostatistics/kxn014; Мыльников С. В., Павлова Н. В., Барабанова Л. В. Антимутагенные эффекты синтетического пептида эпиталона у мышей, Mus musculus, различающихся по окраске шерсти. Экологическая генетика. 2011;9(3):75–88. https://doi.org/10.17816/ecogen9375-88; Глотов Н. В., Филатов А. А., Хромов-Борисов Н. Н. Сборник задач по биометрии. Л.: Изд-во ЛГУ; 1985. 81 с.; Мыльников С. В. Зависимость дисперсии выживаемости от возраста когорты у Drosophila melanogaster. Сообщение 1: Норма реакции выживаемости и ее наследование. Успехи геронтологии. 2018;31(3):323–329.; Sullivan G. M., Feinn R. S. Facts and fictions about handling multiple comparisons. Journal of Graduate Medical Education. 2021;13(4):457–460. https://doi.org/10.4300/JGME-D-21-00599.1; Bonett D. G., Wright T. A. Sample size requirements for estimating Pearson, Kendall, and Spearman correlations. Psychometrika. 2000;65(1):23–28. https://doi.org/10.1007/BF02294183; Gnambs T. A brief note on the standard error of the Pearson correlation. Collabra: Psychology. 2023;9(1):87615. https://doi.org/10.1525/collabra.87615; Федорова Е. М., Мыльников С. В. Нелегкий путь к диплому. СПб.: Изд-во Н-Л; 2012. 100 с.; Killeen P. R. An alternative to null hypothesis significance tests. Psychological Science. 2005;16(5):345–353. https://doi.org/10.1111/j.0956-7976.2005.01538.x; Lazzeroni L. C., Lu Y., Belitskaya-Lévy I. Solutions for quantifying P-value uncertainty and replication power. Nature Methods. 2016;13(2):107–108. https://doi.org/10.1038/nmeth.3741; Berry D. A p-value to die for. Journal of the American Statistical Association. 2017;112(519):895–897. https://doi.org/10.1080/01621459.2017.1316279; Campbell J. P. Editorial: Some remarks from the outgoing editor. Journal of Applied Psychology. 1982;67(6):691–700. https://doi.org/10.1037/h0077946; Geffré A., Concordet D., Braun J. P., Trumel C. Reference Value Advisor: A new freeware set of macroinstructions to calculate reference intervals with Microsoft Excel. Veterinary Clinical Pathology. 2011;40(1):107–112. https://doi.org/10.1111/j.1939-165X.2011.00287.x; Bornstein M. Common mistakes in meta-analysis and how to avoid them. Biostat, Inc. 2019. 409 p. Available at: https://meta-analysis.com/#downloadBookAndPaper (accessed: 27.01.2024).; Suurmond R., van Rhee H., Hak T. Introduction, comparison, and validation of Meta-Essentials: A free and simple tool for meta-analysis. Research Synthesis Methods. 2017;8(4):537–553. https://doi.org/10.1002/jrsm.1260; Borenstein M., Higgins J. P., Hedges L. V., Rothstein H. R. Basics of meta-analysis: I2 is not an absolute measure of heterogeneity. Research Synthesis Methods. 2017;8(1):5–18. https://doi.org/10.1002/jrsm.1230; Фишер Р. А. Математика дамы, дегустирующей чай. В кн.: Современные проблемы математики: сб. ст. М.: Знание; 1981. С. 46–58.; Cohen J. Things I have learned (so far). American Psychologist. 1990;45(12):1304–1312. https://doi.org/10.1037/0003-066X.45.12.1304; Хромов-Борисов Н. Н. Табличная форма описания статистических методов и программ в научных публикациях. Научный редактор и издатель. 2022;7(2)6:182–184. https://doi.org/10.24069/SEP-22-40; https://www.scieditor.ru/jour/article/view/398
Rights: Authors who publish in this journal agree to the following: 1. Authors retain copyright of the work and provide the journal right of first publication of the work. 2. The authors retain the right to enter into certain contractual agreements relating to the non-exclusive distribution in the published version of the work here form (eg, post it to an institutional repository, the publication of the book), with reference to its original publication in this journal. 3. The authors have the right to post their work on the Internet (eg in the institute store or personal website) prior to and during the review process of its data log, as this may lead to a productive discussion and a large number of references to this work (See. The Effect of Open Access). ; Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
Processing Request
No Comments.